على الرغم من أن المئذنة تعود الى عصر السلاجقة ولكنها تبقى مرتبطة عضوياً بالجامع فالمئذنة تقع في الجهة الشمالية الغربية من الجامع مبنية على غرار المآذن البرجية المربعة الشكل ويبلغ ارتفاعها 42 متراً تقريباً ويصعد إليها من باب صغير يؤدي الى درجات عددها 145 درجة تؤدي الى الموقف الأخير للمآذن وطوقت المئذنة بأربعة أدوار يحمل كل منها زخارف تختلف في كل دور عن الآخر .‏ المئذنة مربعة المسقط يراوح طول ضلعها بين »4،929«م و»4،65«م . وتتكون من خمس طبقات تحد كلاً منها نصوص كتابية بالخطين الكوفي المورق والنسخي تحيط بأضلاعها الأربعة ،ومن طبقة أخيرة هي طبقة شرفة المؤذن والجوسق والقبة الكروبة التي تنتهي بها المئذنة علماً أن الارتفاع الكلي للمئذنة »45،39« م‏